在醫(yī)學(xué)界,血液腫瘤是一類具有高度異質(zhì)性的疾病,其診療需要結(jié)合形態(tài)學(xué)、免疫學(xué)、遺傳學(xué)和分子生物學(xué)進(jìn)行綜合分析。血液腫瘤中常見的分子生物學(xué)異常主要包括基因突變、融合基因及基因異常表達(dá)。目前NGS在基因突變的檢測方面應(yīng)用最為廣泛和成熟,CEIDI西遞在本文整理的內(nèi)僅涉及基因突變的檢測。
二代測序NGS實驗室,是一種用于基因檢測(高通量測序檢測)的實驗室,建設(shè)二代測序NGS實驗室的重點,主要在設(shè)計布局分區(qū)、 結(jié)構(gòu)材料、氣壓調(diào)節(jié)、消毒、照明、傳遞窗幾個方面。
二代測序(NGS)實驗室裝修設(shè)計行業(yè)規(guī)范 CEIDI西遞
一、二代測序NGS實驗室的設(shè)計布局分區(qū)
二代測序NGS實驗室的設(shè)計分區(qū),主要將實驗室劃分為4個區(qū)域,即:試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本與文庫制備區(qū)、文庫擴(kuò)增與檢測區(qū)、測序區(qū)。
1. 試劑準(zhǔn)備區(qū)
NGS實驗室試劑準(zhǔn)備區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:
(1)區(qū)域功能:用于實驗項目所需試劑的配制、分裝和保存。
(2)儀器配備:必須配備加樣器、冰箱、分析天平、微量臺式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈、超凈工作臺等儀器設(shè)備。
2. 標(biāo)本與文庫制備區(qū)
NGS實驗室標(biāo)本與文庫制備區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:
(1)區(qū)域功能:用于血液處理、血漿制備、DNA提取、DNA片段化、DNA樣品的純化、DNA濃度檢測、末端修復(fù)、接頭連接、構(gòu)建樣本的測序文庫。
(2)儀器配備:必須配備冷凍離心機(jī)、微量臺式離心機(jī)、掌上三管離心機(jī)、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0核酸定量儀、電腦(可連接互聯(lián)網(wǎng))、條形碼打印機(jī)、普通打印機(jī)、掃描槍、磁力架等儀器設(shè)備。
3. 文庫擴(kuò)增與檢測區(qū)
NGS實驗室文庫擴(kuò)增與檢測區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:
(1)區(qū)域功能:用于文庫構(gòu)建后的PCR擴(kuò)增與純化、文庫濃度檢測、文庫的混合及混合后的質(zhì)檢分析。
(2)儀器配備:必須配備PCR儀、QPCR儀、Qubit2.0核酸定量儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機(jī)、渦旋振蕩器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等儀器設(shè)備。
4. 測序區(qū)
NGS實驗室測序區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:
(1)區(qū)域功能:用于測序模板制備,如乳液PCR與磁珠富集回收,以及上機(jī)測序、數(shù)據(jù)分析、報告審核及發(fā)放。
(2)儀器配備:必須配備高通量測序儀、PC電腦、打印機(jī)、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺、可移動紫外燈、磁力架、PCR儀等儀器設(shè)備。
二、二代測序NGS實驗室的主體結(jié)構(gòu)材料
二代測序NGS實驗室設(shè)計裝修要以彩鋼板與鋁合金材料為主體建材,室內(nèi)陰角與陽角采用鋁合金50內(nèi)圓角鋁,這樣做的好處是內(nèi)部結(jié)構(gòu)牢固、密封性好,且不易污染、積塵。
三、二代測序NGS實驗室的氣壓調(diào)節(jié)
二代測序NGS實驗室在氣壓調(diào)節(jié)上,要在實驗區(qū)的外墻和各扇門上安裝風(fēng)量可調(diào)的回風(fēng)口,空氣通過回風(fēng)口向室內(nèi)換氣。
四、二代測序NGS實驗室的消毒與照明
在消毒上,二代測序NGS實驗室的實驗區(qū)、緩沖區(qū)頂部、傳送窗內(nèi)部要配備用于消毒的紫外燈。如果要對實驗桌進(jìn)行局部消毒,還要配備移動紫外線燈;在照明上,照明設(shè)備必須不積塵、易清潔才行,這里CEIDI西遞建議配備凈化燈具。
五、二代測序NGS實驗室的傳遞窗
傳遞窗分為機(jī)械連鎖型與電子連鎖型,二代測序NGS實驗室設(shè)計裝修建議配備前者,以便確保樣本與試劑在傳遞過程中不會受到污染。